Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG6

Traip, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraipQ8VIG6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TraipQ8VIG6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TraipQ8VIG6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms