Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ppargc1bQ8VHJ7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms