Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc115Q8VE99 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc115Q8VE99 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc115Q8VE99 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc115Q8VE99 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc115Q8VE99 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc115Q8VE99 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc115Q8VE99 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc115Q8VE99 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc115Q8VE99 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc115Q8VE99 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc115Q8VE99 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc115Q8VE99 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc115Q8VE99 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc115Q8VE99 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc115Q8VE99 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc115Q8VE99 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc115Q8VE99 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc115Q8VE99 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc115Q8VE99 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms