Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc39cQ8VE09 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc39cQ8VE09 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc39cQ8VE09 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
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Ttc39cQ8VE09 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Ttc39cQ8VE09 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc39cQ8VE09 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc39cQ8VE09 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc39cQ8VE09 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc39cQ8VE09 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Ttc39cQ8VE09 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Ttc39cQ8VE09 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc39cQ8VE09 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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