Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK5

Klhl20, Kelch-like protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl20Q8VCK5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl20Q8VCK5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl20Q8VCK5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl20Q8VCK5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl20Q8VCK5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl20Q8VCK5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl20Q8VCK5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl20Q8VCK5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl20Q8VCK5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl20Q8VCK5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl20Q8VCK5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl20Q8VCK5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhl20Q8VCK5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl20Q8VCK5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms