Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpm8Q8R4D5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpm8Q8R4D5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm8Q8R4D5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms