Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc12Q8K5B8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms