Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z0

Lgi2, Leucine-rich repeat LGI family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi2Q8K4Z0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lgi2Q8K4Z0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lgi2Q8K4Z0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgi2Q8K4Z0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms