Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X8

Gtf2h5, General transcription factor IIH subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2h5Q8K2X8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf2h5Q8K2X8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gtf2h5Q8K2X8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf2h5Q8K2X8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms