Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Paf1Q8K2T8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Paf1Q8K2T8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Paf1Q8K2T8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Paf1Q8K2T8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms