Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scara5Q8K299 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scara5Q8K299 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scara5Q8K299 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scara5Q8K299 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scara5Q8K299 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scara5Q8K299 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scara5Q8K299 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scara5Q8K299 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scara5Q8K299 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scara5Q8K299 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scara5Q8K299 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scara5Q8K299 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scara5Q8K299 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scara5Q8K299 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Scara5Q8K299 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Scara5Q8K299 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scara5Q8K299 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scara5Q8K299 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scara5Q8K299 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Scara5Q8K299 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms