Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcf3Q8K268 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Abcf3Q8K268 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms