Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbrd1Q8K0B2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lmbrd1Q8K0B2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lmbrd1Q8K0B2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms