Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LgsnQ8CIX8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LgsnQ8CIX8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LgsnQ8CIX8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms