Protein–RNA interactions for Protein: Q8CID3

Fam20a, Pseudokinase FAM20A, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20aQ8CID3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam20aQ8CID3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam20aQ8CID3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms