Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rftn2Q8CHX7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rftn2Q8CHX7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rftn2Q8CHX7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms