Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab11fip3Q8CHD8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rab11fip3Q8CHD8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rab11fip3Q8CHD8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rab11fip3Q8CHD8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rab11fip3Q8CHD8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rab11fip3Q8CHD8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rab11fip3Q8CHD8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rab11fip3Q8CHD8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rab11fip3Q8CHD8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rab11fip3Q8CHD8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rab11fip3Q8CHD8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rab11fip3Q8CHD8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rab11fip3Q8CHD8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rab11fip3Q8CHD8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rab11fip3Q8CHD8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab11fip3Q8CHD8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms