Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gpc3Q8CFZ4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc3Q8CFZ4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc3Q8CFZ4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms