Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc73Q8CDM4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc73Q8CDM4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc73Q8CDM4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms