Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nhsl1Q8CAF4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nhsl1Q8CAF4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nhsl1Q8CAF4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nhsl1Q8CAF4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nhsl1Q8CAF4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nhsl1Q8CAF4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nhsl1Q8CAF4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nhsl1Q8CAF4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nhsl1Q8CAF4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nhsl1Q8CAF4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nhsl1Q8CAF4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nhsl1Q8CAF4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nhsl1Q8CAF4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nhsl1Q8CAF4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nhsl1Q8CAF4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nhsl1Q8CAF4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nhsl1Q8CAF4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Nhsl1Q8CAF4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Nhsl1Q8CAF4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Nhsl1Q8CAF4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nhsl1Q8CAF4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nhsl1Q8CAF4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nhsl1Q8CAF4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
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