Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc113Q8C5T8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc113Q8C5T8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc113Q8C5T8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms