Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8C5C9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8C5C9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8C5C9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8C5C9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8C5C9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8C5C9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8C5C9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8C5C9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8C5C9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8C5C9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8C5C9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8C5C9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8C5C9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q8C5C9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q8C5C9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q8C5C9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q8C5C9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q8C5C9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q8C5C9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q8C5C9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q8C5C9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q8C5C9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q8C5C9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q8C5C9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q8C5C9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q8C5C9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q8C5C9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q8C5C9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q8C5C9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q8C5C9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q8C5C9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Q8C5C9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q8C5C9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
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