Protein–RNA interactions for Protein: Q8C165

Pm20d1, N-fatty-acyl-amino acid synthase/hydrolase PM20D1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d1Q8C165 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pm20d1Q8C165 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pm20d1Q8C165 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pm20d1Q8C165 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pm20d1Q8C165 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pm20d1Q8C165 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pm20d1Q8C165 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pm20d1Q8C165 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pm20d1Q8C165 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pm20d1Q8C165 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pm20d1Q8C165 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pm20d1Q8C165 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pm20d1Q8C165 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms