Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn17Q8BXA6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms