Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rbbp5Q8BX09 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbbp5Q8BX09 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms