Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ctdsp2Q8BX07 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ctdsp2Q8BX07 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctdsp2Q8BX07 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Ctdsp2Q8BX07 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
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