Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPZ8

Abraxas1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abraxas1Q8BPZ8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abraxas1Q8BPZ8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abraxas1Q8BPZ8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abraxas1Q8BPZ8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms