Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan12Q8BKT6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tspan12Q8BKT6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan12Q8BKT6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms