Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
D130040H23RikQ8BII3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
D130040H23RikQ8BII3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
D130040H23RikQ8BII3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms