Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabra5Q8BHJ7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabra5Q8BHJ7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gabra5Q8BHJ7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabra5Q8BHJ7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabra5Q8BHJ7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabra5Q8BHJ7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gabra5Q8BHJ7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gabra5Q8BHJ7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabra5Q8BHJ7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms