Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Susd4Q8BH32 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Susd4Q8BH32 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Susd4Q8BH32 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Susd4Q8BH32 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Susd4Q8BH32 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Susd4Q8BH32 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Susd4Q8BH32 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Susd4Q8BH32 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Susd4Q8BH32 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Susd4Q8BH32 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Susd4Q8BH32 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Susd4Q8BH32 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Susd4Q8BH32 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Susd4Q8BH32 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Susd4Q8BH32 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Susd4Q8BH32 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Susd4Q8BH32 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Susd4Q8BH32 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Susd4Q8BH32 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Susd4Q8BH32 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Susd4Q8BH32 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Susd4Q8BH32 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Susd4Q8BH32 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Susd4Q8BH32 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Susd4Q8BH32 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Susd4Q8BH32 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Susd4Q8BH32 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Susd4Q8BH32 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Susd4Q8BH32 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Susd4Q8BH32 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Susd4Q8BH32 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms