Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX2

Timm29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm29Q8BGX2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Timm29Q8BGX2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Timm29Q8BGX2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Timm29Q8BGX2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Timm29Q8BGX2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Timm29Q8BGX2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Timm29Q8BGX2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Timm29Q8BGX2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Timm29Q8BGX2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Timm29Q8BGX2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Timm29Q8BGX2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Timm29Q8BGX2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Timm29Q8BGX2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Timm29Q8BGX2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Timm29Q8BGX2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Timm29Q8BGX2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Timm29Q8BGX2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Timm29Q8BGX2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Timm29Q8BGX2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Timm29Q8BGX2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Timm29Q8BGX2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Timm29Q8BGX2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Timm29Q8BGX2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms