Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms