Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bhlhe23Q8BGW3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe23Q8BGW3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe23Q8BGW3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms