Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim6Q8BGE7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim6Q8BGE7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim6Q8BGE7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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