Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc172Q810N9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc172Q810N9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc172Q810N9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc172Q810N9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms