Protein–RNA interactions for Protein: Q80X82

Sympk, Symplekin, mousemouse

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SympkQ80X82 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SympkQ80X82 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SympkQ80X82 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SympkQ80X82 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SympkQ80X82 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SympkQ80X82 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SympkQ80X82 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SympkQ80X82 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SympkQ80X82 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SympkQ80X82 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SympkQ80X82 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SympkQ80X82 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SympkQ80X82 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SympkQ80X82 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SympkQ80X82 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SympkQ80X82 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SympkQ80X82 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SympkQ80X82 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SympkQ80X82 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SympkQ80X82 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SympkQ80X82 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SympkQ80X82 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SympkQ80X82 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SympkQ80X82 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SympkQ80X82 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SympkQ80X82 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SympkQ80X82 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SympkQ80X82 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SympkQ80X82 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SympkQ80X82 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SympkQ80X82 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SympkQ80X82 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SympkQ80X82 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SympkQ80X82 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SympkQ80X82 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SympkQ80X82 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SympkQ80X82 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SympkQ80X82 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SympkQ80X82 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SympkQ80X82 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SympkQ80X82 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SympkQ80X82 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms