Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcsk9Q80W65 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pcsk9Q80W65 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcsk9Q80W65 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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