Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpp38Q80UU2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpp38Q80UU2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpp38Q80UU2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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