Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nphp3Q7TNH6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nphp3Q7TNH6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms