Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf139Q7TMV1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf139Q7TMV1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf139Q7TMV1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms