Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sys1Q78S06 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sys1Q78S06 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sys1Q78S06 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms