Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zc3h4Q6ZPZ3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zc3h4Q6ZPZ3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zc3h4Q6ZPZ3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zc3h4Q6ZPZ3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms