Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNU9

Tlr12, Toll-like receptor 12, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr12Q6QNU9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlr12Q6QNU9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlr12Q6QNU9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlr12Q6QNU9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr12Q6QNU9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr12Q6QNU9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr12Q6QNU9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr12Q6QNU9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr12Q6QNU9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr12Q6QNU9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Tlr12Q6QNU9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tlr12Q6QNU9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlr12Q6QNU9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlr12Q6QNU9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlr12Q6QNU9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlr12Q6QNU9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tlr12Q6QNU9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tlr12Q6QNU9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tlr12Q6QNU9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tlr12Q6QNU9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tlr12Q6QNU9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tlr12Q6QNU9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tlr12Q6QNU9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tlr12Q6QNU9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms