Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIC6

Atp1a3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a3Q6PIC6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp1a3Q6PIC6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp1a3Q6PIC6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.5 ms