Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Kcnip4Q6PHZ8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnip4Q6PHZ8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip4Q6PHZ8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms