Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc57Q6PHN1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc57Q6PHN1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 269.7 ms