Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Gapvd1Q6PAR5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Gapvd1Q6PAR5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Gapvd1Q6PAR5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Gapvd1Q6PAR5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Gapvd1Q6PAR5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Gapvd1Q6PAR5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Gapvd1Q6PAR5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Gapvd1Q6PAR5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Gapvd1Q6PAR5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Gapvd1Q6PAR5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Gapvd1Q6PAR5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Gapvd1Q6PAR5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Gapvd1Q6PAR5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Gapvd1Q6PAR5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Gapvd1Q6PAR5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Gapvd1Q6PAR5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Gapvd1Q6PAR5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Gapvd1Q6PAR5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Gapvd1Q6PAR5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Gapvd1Q6PAR5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Gapvd1Q6PAR5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Gapvd1Q6PAR5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Gapvd1Q6PAR5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Gapvd1Q6PAR5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Gapvd1Q6PAR5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Gapvd1Q6PAR5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Gapvd1Q6PAR5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Gapvd1Q6PAR5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Gapvd1Q6PAR5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Gapvd1Q6PAR5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Gapvd1Q6PAR5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Gapvd1Q6PAR5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Gapvd1Q6PAR5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Gapvd1Q6PAR5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Gapvd1Q6PAR5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Gapvd1Q6PAR5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Gapvd1Q6PAR5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Gapvd1Q6PAR5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Gapvd1Q6PAR5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Gapvd1Q6PAR5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Gapvd1Q6PAR5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Gapvd1Q6PAR5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Gapvd1Q6PAR5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Gapvd1Q6PAR5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Gapvd1Q6PAR5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Gapvd1Q6PAR5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Gapvd1Q6PAR5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Gapvd1Q6PAR5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Gapvd1Q6PAR5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Gapvd1Q6PAR5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Gapvd1Q6PAR5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Gapvd1Q6PAR5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Gapvd1Q6PAR5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Gapvd1Q6PAR5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Gapvd1Q6PAR5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Gapvd1Q6PAR5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Gapvd1Q6PAR5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Gapvd1Q6PAR5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Gapvd1Q6PAR5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Gapvd1Q6PAR5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Gapvd1Q6PAR5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Gapvd1Q6PAR5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Gapvd1Q6PAR5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Gapvd1Q6PAR5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Gapvd1Q6PAR5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Gapvd1Q6PAR5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms