Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atl2Q6PA06 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Atl2Q6PA06 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atl2Q6PA06 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms