Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4U0

Thsd7b, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7bQ6P4U0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Thsd7bQ6P4U0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Thsd7bQ6P4U0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Thsd7bQ6P4U0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Thsd7bQ6P4U0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Thsd7bQ6P4U0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Thsd7bQ6P4U0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Thsd7bQ6P4U0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thsd7bQ6P4U0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thsd7bQ6P4U0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thsd7bQ6P4U0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thsd7bQ6P4U0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thsd7bQ6P4U0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Thsd7bQ6P4U0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thsd7bQ6P4U0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thsd7bQ6P4U0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thsd7bQ6P4U0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms