Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm2bQ6P1G2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm2bQ6P1G2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Kdm2bQ6P1G2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Kdm2bQ6P1G2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Kdm2bQ6P1G2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Kdm2bQ6P1G2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Kdm2bQ6P1G2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm2bQ6P1G2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm2bQ6P1G2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm2bQ6P1G2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm2bQ6P1G2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms